“İkinci bin yılın müceddidi” olarak anılan İmâm-ı Rabbânî, Bâbürlü hükümdarlarıyla kurduğu ilişkiler ve onlara verdiği nasihatler aracılığıyla hem siyasî hem de dinî yapıyı derinden etkilemiştir. Hint Alt Kıtası’ndaki ilk ihyâ hareketinin mimarı olan İmâm-ı Rabbânî, itikadî esasların ve şer’i hükümlerin hilafına hareket eden Ekber Şah’a karşı kati bir muhalefet yürütmüştür. Ekber Şah’ın oğlu Cihangir döneminde hapsedilmiş olsa da onunla ilişkileri daha ılımlı seyretmiştir.